Végétaux marins et biomolécules - UMR 7139

structures macromoléculaires, plantes et produits du végétal, microbiologie, métabolisme, génome, génomique, génétique moléculaire, évolution, écosystème marin, cristallochimie, algues, stress abiotiques et biotiques, paroi, polysaccharides, développement, morphogénèse.

Equipe Stress Abiotique et Génomique fonctionnelle chez les Macroalgues ; Contact : Catherine Boyen
Equipe Génétique des algues ; Contact : Mark Cock
Equipe Défense des algues ; Contact : Philippe Potin
Equipe Glycobiologie Marine ; Contact Mirjam Czjzek
Equipe Structure des polysaccharides marins ; Contact : William Helbert

Equipe Morphogénèse des Macroalgues; Contact : Bénédicte Charrier

• Le développement de l’algue brune filamenteuse Ectocarpus siliculosus en tant que nouveau modèle biologique
• Projet génome (en collaboration avec Génoscope) et développement d’outils
• Structure et fonction de la paroi
  Interactions proteines/polysaccharides
• L’immunité innée et le stress
  Métabolismes des halogènes et des oxylipines
• Génétique, Développement et Morphogénèse chez les algues brunes
  Contrôle génétique du cycle de vie haplo-diploïde
  Patrons de développement et morphogénèse
• Projet génome de l’algue rouge Chondrus crispus (en collaboration avec Génoscope)

L’étude des assemblages biologiques complexes :

1) la paroi, appréhendée comme un compartiment cellulaire à part entière et sur lequel nous travaillons depuis longtemps,

2) les assemblages moléculaires adhésifs qui permettent aux algues de se fixer au substrat,

3) les biofilms bactériens, thématique émergente plus récente qui fait également appel à des approches d’écologie chimique.

• Séquençage du génome complet de l’algue brune Ectocarpus siliculosus
• Identification et purification des haloperoxidases des algues brunes impliquées dans le cycle géochimie de l’iode en milieu côtier
• Mise en évidence et caractérisation d’une nouvelle famille d’enzymes dégradant les polysaccharides (carraghénanes) des algues rouges
• Séquençage et annotation complète du génome de la bactérie marine Zobellia galactanivorans

• Inter///Bio (UPMC)
• Logique du Vivant (UPMC)
• Diversité du Vivant (UPMC)

Locaux

FR2424

Nationaux

GIS Europôle Mer, GIS Ouest Génopole®, GIS Biophysique du Grand Ouest, Génoscope

Internationaux

Réseau d’excellence Marine Genomics Europe

Laboratoire international associé : LIA DIAMS http://www.sb-roscoff.fr/lia.html
Max Plank Institut à Bremen ;
Université Catholique de Santiago du Chile ;
Marine Biological Association, Plymouth ;
Max Plank Institut à Iena ;
Wood Biotechnology, KTH, Stockholm, Sweden ;
University of Newcastle.

Laboratoires Servier, Degussa, CP Kelco 

• Chaines de chromatographie pour sucres et pour protéines,
• Fermenteur,
• Salles et armoires de cultures d’algues.

• Bouarab K., Adas F., Gaquerel E., Kloareg B., Salaün J.P. and Potin P., (2004).
  The innate immunity of a marine Red alga involves oxylipins from both the eicosanoid and octadecanoid pathways.
  Plant Physiology, 135 : 1838-1848.
• Colin C., Leblanc C., Michel G., Wagner E., Leize-Wagner E., Van Dorsselaer A. and Potin P. (2005)
  Vanadium-dependent iodoperoxidases in Laminaria digitata, a novel biochemical function diverging from brown algal bromoperoxidases.
  J. Biol. Inorg. Chem., 10 : 156-166.
• Feiters M.C., Leblanc C., Küpper F.C., Meyer-Klaucke W., Michel G. and Potin P. (2005).
  Bromine is an Endogenous Component of a Vanadium Bromoperoxidase.
  J. Am. Chem. Soc. (Comm.) 127 : 15340-15341
• Colin S, Deniaud E, Jam M, Descamps V, Chevolot Y, Kervarec N, Yvin JC, Barbeyron T, Michel G and Kloareg B. (2006)
  Cloning and biochemical characterization of the fucanase FcnA : definition of a novel glycoside hydrolase family specific for sulfated fucans.
  Glycobiology, 16, 1021-1032.
• Collén J, Guisle-Marsollier I, Leger JJ & Boyen C (2008)
  Response of the transcriptome of the intertidal red seaweed Chondrus crispus to controlled and natural stresses.
  New Phytologist, in press
• Guibet M., Colin S., Barbeyron T., Génicot S., Kloareg B., Michel G. and Helbert W. (2007).
  The degradation of the most sulphated carrageenan by the Pseudoalteromonas carrageenovora -carrageenase : a new family of glycoside hydrolases unrelated to - and -carrageenases. Biochemical
  Journal 404 : 105-114.
• Peters, A.F., Scornet, D., Ratin, M., Charrier, B., Monnier, A., Merrien, Y., Corre, E., Coelho, S. and Cock, J.M. (2008)
  Life-cycle-generation-specific developmental processes are modified in the immediate upright mutant of the brown alga Ectocarpus siliculosus. Development, published online

Enseignants-chercheurs :

Personnels d'appui à la recherche :

Post-doctorants :

Doctorants :

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